Immunogenicity 8451
Sample ID
3995
Response
Negative
Tumor Type
Colon cancer
Gene Symbol
MUC2
Transcript ID
NM_002457
HLA INFO
DQA*05:01 / DQB*02:02
TCR INFO
No TCR info found!
Full length protein sequence (5289 aa)
MGLPL
1
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6
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16
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SCDTG
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GDCEC
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TPTST
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TTTTT
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TPTGT
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TPTPT
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PISTT
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TPIST
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TGTQT
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PTLTP
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TPTGT
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QAPTP
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TAITT
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TPTPT
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PTGTQ
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TTTTT
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TPTGT
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TTTTT
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PTGTQ
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TPTPT
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TTVTP
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TPTPT
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TTTTT
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TTTPI
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TTTTT
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PTTTP
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CCKEE
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EVVLS
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SLTHT
5251
YTHIE
5256
SCQCQ
5261
DTVCG
5266
LPTGT
5271
SRRAR
5276
RSPRH
5281
LGSG
5286
Mutation Information
DNA mutation:
None
Peptide Range:
1430 ~ 1454
Mut AA position:
1442 (13 in Wild Type peptide)
Alignment
Wild Type:
"TTPPPTTTPSPPITTTTTPPPTTTP
||||||||||||.||||||||||||
Mutant:
TTPPPTTTPSPPTTTTTTPPPTTTP"
Science, 2015
Immunogenicity of somatic mutations in human gastrointestinal cancersGene Name (from Reference) MUC2
Checkpoint
Blockade
None
ACT
None
Vaccination
None
Curative
Effect
None
minimal_peptide
None
Antigen
Type
TMG RNA
T-cell
Source
TILs
APC
Type
autologous DCs
Assay
IFNg ELISPOT assay