Immunogenicity 15581
Sample ID
4095
Response
Negative
Tumor Type
Colorectal cancer
Gene Symbol
PRG4 (FPKM: 0.52)
Transcript ID
NM_001127708
HLA INFO
C*08:02
TCR INFO
No TCR info found!
Full length protein sequence (1363 aa)
MAWKT
1
LPIYL
6
LLLLS
11
VFVIQ
16
QVSSQ
21
ELSCK
26
GRCFE
31
SFERG
36
RECDC
41
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46
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51
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56
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61
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66
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71
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76
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81
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86
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91
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96
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101
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106
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111
EHSVS
116
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121
SSSSS
126
SSSSS
131
STIRK
136
IKSSK
141
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146
RELQK
151
KLKVK
156
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161
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166
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171
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176
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181
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186
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191
DTSTT
196
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201
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206
ITTAK
211
PINPR
216
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221
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226
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231
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236
TTVET
241
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246
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251
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256
EKTTS
261
AKETQ
266
SIEKT
271
SAKDL
276
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281
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286
TPKAE
291
TTTKG
296
PALTT
301
PKEPT
306
PTTPK
311
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316
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321
TPTTI
326
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331
TPKEP
336
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341
KSAPT
346
TPKEP
351
APTTT
356
KEPAP
361
TTPKE
366
PAPTT
371
TKEPA
376
PTTTK
381
SAPTT
386
PKEPA
391
PTTPK
396
KPAPT
401
TPKEP
406
APTTP
411
KEPTP
416
TTPKE
421
PAPTT
426
KEPAP
431
TTPKE
436
PAPTA
441
PKKPA
446
PTTPK
451
EPAPT
456
TPKEP
461
APTTT
466
KEPSP
471
TTPKE
476
PAPTT
481
TKSAP
486
TTTKE
491
PAPTT
496
TKSAP
501
TTPKE
506
PSPTT
511
TKEPA
516
PTTPK
521
EPAPT
526
TPKKP
531
APTTP
536
KEPAP
541
TTPKE
546
PAPTT
551
TKKPA
556
PTTPK
561
EPAPT
566
TPKET
571
APTTP
576
KKLTP
581
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586
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591
PEKPA
596
PTTPE
601
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606
TPEEP
611
TPTTP
616
EEPAP
621
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626
AAPNT
631
PKEPA
636
PTTPK
641
EPAPT
646
TPKEP
651
APTTP
656
KETAP
661
TTPKG
666
TAPTT
671
LKEPA
676
PTTPK
681
KPAPK
686
ELAPT
691
TTKEP
696
TSTTS
701
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706
TTPKG
711
TAPTT
716
PKEPA
721
PTTPK
726
EPAPT
731
TPKGT
736
APTTL
741
KEPAP
746
TTPKK
751
PAPKE
756
LAPTT
761
TKGPT
766
STTSD
771
KPAPT
776
TPKET
781
APTTP
786
KEPAP
791
TTPKK
796
PAPTT
801
PETPP
806
PTTSE
811
VSTPT
816
TTKEP
821
TTIHK
826
SPDES
831
TPELS
836
AEPTP
841
KALEN
846
SPKEP
851
GVPTT
856
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861
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866
TTTAK
871
DKTTE
876
RDLRT
881
TPETT
886
TAAPK
891
MTKET
896
ATTTE
901
KTTES
906
KITAT
911
TTQVT
916
STTTQ
921
DTTPF
926
KITTL
931
KTTTL
936
APKVT
941
TTKKT
946
ITTTE
951
IMNKP
956
EETAK
961
PKDRA
966
TNSKA
971
TTPKP
976
QKPTK
981
APKKP
986
TSTKK
991
PKTMP
996
RVRKP
1001
KTTPT
1006
PRKMT
1011
STMPE
1016
LNPTS
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RIAEA
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MLQTT
1031
TRPNQ
1036
TPNSK
1041
LVEVN
1046
PKSED
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MLLRP
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HVFMP
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1076
MDYLP
1081
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1086
GIIIN
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NGKPV
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DGLTT
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LVAFR
1121
GHYFW
1126
MLSPF
1131
SPPSP
1136
ARRIT
1141
EVWGI
1146
PSPID
1151
TVFTR
1156
CNCEG
1161
KTFFF
1166
KDSQY
1171
WRFTN
1176
DIKDA
1181
GYPKP
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1191
GGLTG
1196
QIVAA
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LSTAK
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YKNWP
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1216
FKRGG
1221
SIQQY
1226
IYKQE
1231
PVQKC
1236
PGRRP
1241
ALNYP
1246
VYGET
1251
TQVRR
1256
RRFER
1261
AIGPS
1266
QTHTI
1271
RIQYS
1276
PARLA
1281
YQDKG
1286
VLHNE
1291
VKVSI
1296
LWRGL
1301
PNVVT
1306
SAISL
1311
PNIRK
1316
PDGYD
1321
YYAFS
1326
KDQYY
1331
NIDVP
1336
SRTAR
1341
AITTR
1346
SGQTL
1351
SKVWY
1356
NCP
1361
Mutation Information
DNA mutation:
c.C3202T
Peptide Range:
1056 ~ 1080
Mut AA position:
1068 (13 in Wild Type peptide)
Alignment
Wild Type:
"AGGAEGETPHMLLRPHVFMPEVTPD
||||||||||||.||||||||||||
Mutant:
AGGAEGETPHMLFRPHVFMPEVTPD"
N Engl J Med, 2016
T-Cell Transfer Therapy Targeting Mutant KRAS in CancerGene Name (from Reference) PRG4
Checkpoint
Blockade
None
ACT
None
Vaccination
None
Curative
Effect
None
minimal_peptide
None
Antigen
Type
TMG RNA
T-cell
Source
TILs
APC
Type
DCs
Assay
IFNg ELISPOT assay