Immunogenicity 2539
Sample ID
4069
Response
Negative
Tumor Type
Pancreatic cancer
Gene Symbol
PRG4
Transcript ID
uc009wym.3
HLA INFO
C*12:02
TCR INFO
No TCR info found!
Full length protein sequence (1270 aa)
MAWKT
1
LPIYL
6
LLLLS
11
VFVIQ
16
QVSSQ
21
ELSCK
26
GRCFE
31
SFERG
36
RECDC
41
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46
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51
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56
SFCAE
61
VKDNK
66
KNRTK
71
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76
KPPVV
81
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86
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91
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96
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101
TTQHN
106
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111
PKITT
116
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121
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126
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131
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136
SLTVN
141
KETTV
146
ETKET
151
TTTNK
156
QTSTD
161
GKEKT
166
TSAKE
171
TQSIE
176
KTSAK
181
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186
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191
KPTPK
196
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201
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206
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211
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216
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221
STTPK
226
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231
TIKSA
236
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241
EPAPT
246
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251
PTTPK
256
EPAPT
261
TTKEP
266
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271
KEPAP
276
TTTKE
281
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286
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291
TTPKE
296
PAPTT
301
PKKPA
306
PTTPK
311
EPAPT
316
TPKEP
321
TPTTP
326
KEPAP
331
TTKEP
336
APTTP
341
KEPAP
346
TAPKK
351
PAPTT
356
PKEPA
361
PTTPK
366
EPAPT
371
TTKEP
376
SPTTP
381
KEPAP
386
TTTKS
391
APTTT
396
KEPAP
401
TTTKS
406
APTTP
411
KEPSP
416
TTTKE
421
PAPTT
426
PKEPA
431
PTTPK
436
KPAPT
441
TPKEP
446
APTTP
451
KEPAP
456
TTTKK
461
PAPTT
466
PKEPA
471
PTTPK
476
ETAPT
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TPKKL
486
TPTTP
491
EKLAP
496
TTPEK
501
PAPTT
506
PEELA
511
PTTPE
516
EPTPT
521
TPEEP
526
APTTP
531
KAAAP
536
NTPKE
541
PAPTT
546
PKEPA
551
PTTPK
556
EPAPT
561
TPKET
566
APTTP
571
KGTAP
576
TTLKE
581
PAPTT
586
PKKPA
591
PKELA
596
PTTTK
601
EPTST
606
TCDKP
611
APTTP
616
KGTAP
621
TTPKE
626
PAPTT
631
PKEPA
636
PTTPK
641
GTAPT
646
TLKEP
651
APTTP
656
KKPAP
661
KELAP
666
TTTKG
671
PTSTT
676
SDKPA
681
PTTPK
686
ETAPT
691
TPKEP
696
APTTP
701
KKPAP
706
TTPET
711
PPPTT
716
SEVST
721
PTTTK
726
EPTTI
731
HKSPD
736
ESTPE
741
LSAEP
746
TPKAL
751
ENSPK
756
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761
TTKTP
766
AATKP
771
EMTTT
776
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781
TERDL
786
RTTPE
791
TTTAA
796
PKMTK
801
ETATT
806
TEKTT
811
ESKIT
816
ATTTQ
821
VTSTT
826
TQDTT
831
PFKIT
836
TLKTT
841
TLAPK
846
VTTTK
851
KTITT
856
TEIMN
861
KPEET
866
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871
RATNS
876
KATTP
881
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886
TKAPK
891
KPTST
896
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906
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PTPRK
916
MTSTM
921
PELNP
926
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931
EAMLQ
936
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941
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946
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VNPKS
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AEGET
966
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971
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981
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NQGII
996
INPML
1001
SDETN
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ICNGK
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1016
TTLRN
1021
GTLVA
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FRGHY
1031
FWMLS
1036
PFSPP
1041
SPARR
1046
ITEVW
1051
GIPSP
1056
IDTVF
1061
TRCNC
1066
EGKTF
1071
FFKDS
1076
QYWRF
1081
TNDIK
1086
DAGYP
1091
KPIFK
1096
GFGGL
1101
TGQIV
1106
AALST
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AKYKN
1116
WPESV
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YFFKR
1126
GGSIQ
1131
QYIYK
1136
QEPVQ
1141
KCPGR
1146
RPALN
1151
YPVYG
1156
ETTQV
1161
RRRRF
1166
ERAIG
1171
PSQTH
1176
TIRIQ
1181
YSPAR
1186
LAYQD
1191
KGVLH
1196
NEVKV
1201
SILWR
1206
GLPNV
1211
VTSAI
1216
SLPNI
1221
RKPDG
1226
YDYYA
1231
FSKDQ
1236
YYNID
1241
VPSRT
1246
ARAIT
1251
TRSGQ
1256
TLSKV
1261
WYNCP
1266
Mutation Information
DNA mutation:
None
Peptide Range:
318 ~ 342
Mut AA position:
330 (13 in Wild Type peptide)
Alignment
Wild Type:
"APTTPKEPTPTTPKEPAPTTKEPAP
||||||||||||.||||||||||||
Mutant:
APTTPKEPTPTTTKEPAPTTKEPAP"
Science, 2015
Immunogenicity of somatic mutations in human gastrointestinal cancersGene Name (from Reference) PRG4
Checkpoint
Blockade
None
ACT
None
Vaccination
None
Curative
Effect
None
minimal_peptide
None
Antigen
Type
TMG RNA
T-cell
Source
TILs
APC
Type
autologous DCs
Assay
IFNg ELISPOT assay